Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIRIP3Q9BW71 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms