Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3GL3Q99963 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms