Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GCNAQ96QF7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms