Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB3IPQ96QF0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms