Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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