Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms