Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY4

TTC28, Tetratricopeptide repeat protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 2,481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28Q96AY4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC28Q96AY4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC28Q96AY4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC28Q96AY4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC28Q96AY4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TTC28Q96AY4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC28Q96AY4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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