Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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UBE2E3Q969T4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2E3Q969T4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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