Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms