Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SMPDL3AQ92484 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms