Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOBEC4Q8WW27 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms