Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SFRP1Q8N474 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms