Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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