Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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C9orf40Q8IXQ3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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