Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TREML1Q86YW5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms