Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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