Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TRAPPC6BQ86SZ2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TRAPPC6BQ86SZ2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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