Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms