Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms