Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms