Protein–RNA interactions for Protein: Q68CK6

ACSM2B, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2BQ68CK6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACSM2BQ68CK6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms