Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms