Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms