Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms