Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SLC39A12Q504Y0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms