Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ANKRD55Q3KP44 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms