Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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PTPRNQ16849 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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PTPRNQ16849 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRNQ16849 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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