Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPROQ16827 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PTPROQ16827 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPROQ16827 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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