Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms