Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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