Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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