Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBBP7Q16576 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBBP7Q16576 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms