Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYPL1Q16563 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms