Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTRK3Q16288 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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