Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKIV2LQ15477 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms