Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMD6Q15008 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSMD6Q15008 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms