Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NBR1Q14596 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NBR1Q14596 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NBR1Q14596 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NBR1Q14596 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NBR1Q14596 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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NBR1Q14596 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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NBR1Q14596 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NBR1Q14596 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NBR1Q14596 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NBR1Q14596 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NBR1Q14596 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NBR1Q14596 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NBR1Q14596 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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