Protein–RNA interactions for Protein: Q14397

GCKR, Glucokinase regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCKRQ14397 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GCKRQ14397 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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