Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CAPSQ13938 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms