Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGA9Q13797 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGA9Q13797 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGA9Q13797 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGA9Q13797 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGA9Q13797 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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ITGA9Q13797 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ITGA9Q13797 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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