Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HTR4Q13639 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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