Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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