Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ATRQ13535 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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