Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPM6BQ13491 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms