Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CDK5R2Q13319 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CDK5R2Q13319 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CDK5R2Q13319 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDK5R2Q13319 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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