Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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