Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LMAN2Q12907 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMAN2Q12907 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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