Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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STX4Q12846 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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STX4Q12846 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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