Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME1Q06323 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms