Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPARDQ03181 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms